De Rotterdamse haven ontvangt 50 miljoen euro van het kabinet om het 'stikstofslot' te kunnen opheffen, wat de uitgifte van bouw- en andere vergunningen weer mogelijk maakt. Dit geld is bestemd voor natuurherstel in diverse Natura2000-gebieden, waaronder Meijendel en Berkheide, Westduinpark en Wapendal, Solleveld en Kapittelduinen, en Voornes Duin.

De maatregelen voor natuurherstel omvatten onder andere het uitzetten van konijnen, de bestrijding van exotische planten en insecten, en het beperken van het aantal fietsers en wandelaars langs de kust. Het uitzetten van konijnen is mede noodzakelijk doordat hun populatie is afgenomen door infectieziekten. Konijnen spelen een rol bij het beheer van de begroeiing in de duinen, wat bijdraagt aan een robuust duin-ecosysteem dat bestand is tegen stikstofdepositie.

Een deel van de genoemde Natura2000-gebieden wordt gebruikt voor drinkwaterwinning en staat onder professioneel beheer van onder andere Dunea. Naast stikstofneerslag zijn waterbeheer en kustbescherming van belang voor het behoud van de natuur in deze gebieden. Deze aanpak is onderdeel van de 'Routekaart naar natuurvergunningverlening in de Rotterdamse Haven', een initiatief van de rijksoverheid, de gemeente Rotterdam en het havenbedrijf.

Minister Van Essen past deze strategie toe als onderdeel van 'gebiedsgerichte plannen' om het stikstofprobleem aan te pakken. Gedeputeerde Arne Weverling van de provincie Zuid-Holland geeft aan dat deze maatregelen de vergunningverlening weer op gang moeten brengen, waardoor bedrijven die plannen hebben weer een aanvraag kunnen indienen. Vergroeningsprojecten in de haven die stil lagen door het uitblijven van vergunningen, kunnen hierdoor weer doorgang vinden.

De Rotterdamse haven zelf is ook gehouden aan het nemen van maatregelen, zoals het bevorderen van nauwere samenwerking tussen bedrijfsleven en natuurorganisaties, het stimuleren van meer elektrisch aangedreven apparatuur en het inzetten van emissiearme schepen. Het Rotterdams Havenbedrijf, de gemeente en de provincie Zuid-Holland hadden eerder al hun zorgen geuit over de economische gevolgen van de stikstofproblematiek.

Naast stikstofproblemen ervaart de haven ook vertraging bij duurzame projecten door capaciteitsproblemen op het elektriciteitsnet. Deze vertragingen hebben geleid tot een verslechterd investeringsklimaat en een ruimtegebrek voor geplande projecten, waaronder de bouw van een eigen terminal voor defensie en de aanlanding van nieuwe windmolenparken. Hoewel de bouw van een nieuwe kerncentrale is geschrapt, blijft de Rotterdamse haven een locatie die in beeld is voor kleine modulaire reactoren (SMR's). Wethouder Tim Versnel van de Rotterdamse haven benadrukt de onderlinge verbondenheid van gebieden in Nederland.